Gastroenterološka poliklinika se nalazi na 2. katu centralnog paviljona a sastoji se od Gastroenterološke ambulante, Endoskopske ambulante i Dnevne bolnice. Narudžbe se vrše preko centralnog naručivanja – 044 553 344 i 044 553 345.

Ezofagogastroduodenoskopija je endoskopska pretraga jednjaka, želuca i početnog dijela duodenuma. Pretraga se obavlja uz lokalnu anesteziju sluznice usne šupljine Xylocain, sprayem. Na pretragu je potrebno doći na tašte. Tijekom pregleda može se učiniti biopsija sluznice želuca, a također je moguće učiniti i terapijski zahvat – sklerozacija krvne žile kod krvarenja/krvareći ulkusi, varikoziteti jednjaka ili želuca i/ili polipektomija.

Moguće je učiniti Urea izdisajni test – test za dijagnostiku Helicobacter pylori infekcije. Test je neinvazivan (nije potrebno raditi gastroskopiju), plaća se 300 kn,  jer nije na bolničkoj listi HZZO-a.